Protein–RNA interactions for Protein: Q12035

FCF2, rRNA-processing protein FCF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCF2Q12035 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.35□□□□□ -1.07
FCF2Q12035 TIR3YIL011W 810 nt8.35□□□□□ -1.07
FCF2Q12035 YJL067WYJL067W 351 nt8.35□□□□□ -1.07
FCF2Q12035 ILV3YJR016C 1758 nt8.34□□□□□ -1.07
FCF2Q12035 MAE1YKL029C 2010 nt8.29□□□□□ -1.08
FCF2Q12035 DBP1YPL119C 1854 nt8.28□□□□□ -1.08
FCF2Q12035 MOT3YMR070W 1473 nt8.26□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 YML089CYML089C 369 nt8.25□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 HXT1YHR094C 1713 nt8.25□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 PRO1YDR300C 1287 nt8.24□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 YNL024CYNL024C 741 nt8.24□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 HMG2YLR450W 3138 nt8.23□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.22□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 POM34YLR018C 900 nt8.22□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 VPS75YNL246W 795 nt8.22□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 OPI10YOL032W 741 nt8.22□□□□□ -1.09
FCF2Q12035 HIS2YFR025C 1008 nt8.21□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 SHY1YGR112W 1170 nt8.21□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 DIF1YLR437C 402 nt8.21□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 TPO4YOR273C 1980 nt8.2□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 YNL115CYNL115C 1935 nt8.19□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 ATG15YCR068W 1563 nt8.19□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 RTG1YOL067C 534 nt8.19□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 SHH4YLR164W 507 nt8.18□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 YOR325WYOR325W 474 nt8.18□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 COQ8YGL119W 1506 nt8.17□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 ACO2YJL200C 2370 nt8.17□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 UGA4YDL210W 1716 nt8.16□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 URA6YKL024C 615 nt8.16□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 ILV2YMR108W 2064 nt8.16□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 PEX25YPL112C 1185 nt8.16□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 ESBP6YNL125C 2022 nt8.15□□□□□ -1.1
FCF2Q12035 UGP1YKL035W 1500 nt8.13□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 FRE6YLL051C 2139 nt8.13□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 PRE6YOL038W 765 nt8.12□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 YBL086CYBL086C 1401 nt8.11□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 RET2YFR051C 1641 nt8.11□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 YMR209CYMR209C 1374 nt8.1□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 CCT2YIL142W 1584 nt8.1□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 CWC15YDR163W 528 nt8.1□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 LIP1YMR298W 453 nt8.1□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 ARO8YGL202W 1503 nt8.09□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 SED1YDR077W 1017 nt8.09□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 MRP20YDR405W 792 nt8.09□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 HUA1YGR268C 597 nt8.09□□□□□ -1.11
FCF2Q12035 KES1YPL145C 1305 nt8.07□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 YAR028WYAR028W 705 nt8.07□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 SGA1YIL099W 1650 nt8.07□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 UFO1YML088W 2007 nt8.07□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 BSP1YPR171W 1731 nt8.05□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 LEU9YOR108W 1815 nt8.05□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 TIF6YPR016C 738 nt8.04□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 URA8YJR103W 1737 nt8.03□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 SFA1YDL168W 1161 nt8.03□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.03□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 PET8YNL003C 855 nt8.03□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 TOM6YOR045W 186 nt8.03□□□□□ -1.12
FCF2Q12035 CYT1YOR065W 930 nt8.02□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 LSB6YJL100W 1824 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 DTR1YBR180W 1719 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 GTB1YDR221W 2109 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 UBX6YJL048C 1191 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 PAU7YAR020C 168 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 SAM1YLR180W 1149 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 OYE3YPL171C 1203 nt8.01□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 YHL008CYHL008C 1884 nt8□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 PSD1YNL169C 1503 nt8□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 YDR010CYDR010C 333 nt8□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 ZAP1YJL056C 2643 nt8□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 DMA2YNL116W 1569 nt7.98□□□□□ -1.13
FCF2Q12035 GAL2YLR081W 1725 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YFL066CYFL066C 1179 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 MET28YIR017C 564 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 BET2YPR176C 978 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 MTG2YHR168W 1557 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 HIP1YGR191W 1812 nt7.96□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 BRR1YPR057W 1026 nt7.95□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 RSC8YFR037C 1674 nt7.95□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.94□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 TOA2YKL058W 369 nt7.94□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 SHB17YKR043C 816 nt7.94□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 RFC1YOR217W 2586 nt7.94□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 ACH1YBL015W 1581 nt7.93□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YDL086WYDL086W 822 nt7.93□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 PEX2YJL210W 816 nt7.93□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 VPS62YGR141W 1404 nt7.93□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 ALP1YNL270C 1722 nt7.92□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YFR018CYFR018C 1092 nt7.91□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 SPP2YOR148C 558 nt7.91□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YPL251WYPL251W 303 nt7.91□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 DIG1YPL049C 1359 nt7.91□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 THI72YOR192C 1800 nt7.91□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 YHR218WYHR218W 1812 nt7.9□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 QDR2YIL121W 1629 nt7.9□□□□□ -1.14
FCF2Q12035 FMS1YMR020W 1527 nt7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms