Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 RAX1YOR301W 1308 nt14.62□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 YEL008WYEL008W 381 nt14.61□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 SHH4YLR164W 507 nt14.61□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 NRT1YOR071C 1797 nt14.61□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 TOM6YOR045W 186 nt14.59□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 PUP1YOR157C 786 nt14.58□□□□□ -0.08
TRM3Q07527 YPI1YFR003C 468 nt14.57□□□□□ -0.08
TRM3Q07527 MSB4YOL112W 1479 nt14.55□□□□□ -0.08
TRM3Q07527 LOT5YKL183W 921 nt14.53□□□□□ -0.08
TRM3Q07527 AAC1YMR056C 930 nt14.52□□□□□ -0.08
TRM3Q07527 HIP1YGR191W 1812 nt14.51□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 TIR3YIL011W 810 nt14.51□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 PCH2YBR186W 1695 nt14.51□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 BOP3YNL042W 1191 nt14.5□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 DUT1YBR252W 444 nt14.49□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt14.47□□□□□ -0.09
TRM3Q07527 RTF1YGL244W 1677 nt14.39□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 YJR114WYJR114W 393 nt14.39□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 AGP1YCL025C 1902 nt14.38□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 ATG15YCR068W 1563 nt14.36□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 MET28YIR017C 564 nt14.35□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 GND1YHR183W 1470 nt14.34□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 PAU5YFL020C 369 nt14.33□□□□□ -0.11
TRM3Q07527 GUT2YIL155C 1950 nt14.32□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 POM34YLR018C 900 nt14.32□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 TIF6YPR016C 738 nt14.32□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 NBP35YGL091C 987 nt14.31□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 YML089CYML089C 369 nt14.31□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 APT2YDR441C 546 nt14.3□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 PGC1YPL206C 966 nt14.3□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 PRO1YDR300C 1287 nt14.28□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 FIT3YOR383C 615 nt14.27□□□□□ -0.12
TRM3Q07527 AQY2YLL052C 450 nt14.26□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 LSB3YFR024C-A 1380 nt14.25□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 CCA1YER168C 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 DUS1YML080W 1272 nt14.24□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 YJL064WYJL064W 396 nt14.23□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 TIM44YIL022W 1296 nt14.21□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 PAU19YMR325W 375 nt14.21□□□□□ -0.13
TRM3Q07527 RIB2YOL066C 1776 nt14.2□□□□□ -0.14
TRM3Q07527 YBR232CYBR232C 360 nt14.18□□□□□ -0.14
TRM3Q07527 SLG1YOR008C 1137 nt14.17□□□□□ -0.14
TRM3Q07527 PAC11YDR488C 1602 nt14.15□□□□□ -0.14
TRM3Q07527 LSC2YGR244C 1284 nt14.13□□□□□ -0.15
TRM3Q07527 AKR2YOR034C 2250 nt14.11□□□□□ -0.15
TRM3Q07527 ZTA1YBR046C 1005 nt14.1□□□□□ -0.15
TRM3Q07527 SMM1YNR015W 1155 nt14.09□□□□□ -0.15
TRM3Q07527 YFL054CYFL054C 1941 nt14.07□□□□□ -0.16
TRM3Q07527 PIB2YGL023C 1908 nt14.06□□□□□ -0.16
TRM3Q07527 RIB1YBL033C 1038 nt14.04□□□□□ -0.16
TRM3Q07527 STP3YLR375W 1032 nt14.03□□□□□ -0.16
TRM3Q07527 ERG6YML008C 1152 nt14.01□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 ALD4YOR374W 1560 nt14.01□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 TIP1YBR067C 633 nt14□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 PRY1YJL079C 900 nt13.99□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 PTK1YKL198C 1989 nt13.98□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 SOD2YHR008C 702 nt13.97□□□□□ -0.17
TRM3Q07527 YAR028WYAR028W 705 nt13.96□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 VRG4YGL225W 1014 nt13.95□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 YJL055WYJL055W 738 nt13.95□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 RDN18-1RDN18-1 1800 nt13.93□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 RDN18-2RDN18-2 1800 nt13.93□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 GAP1YKR039W 1809 nt13.91□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 STR3YGL184C 1398 nt13.91□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 THI72YOR192C 1800 nt13.9□□□□□ -0.18
TRM3Q07527 ALP1YNL270C 1722 nt13.88□□□□□ -0.19
TRM3Q07527 HXT12YIL170W 1374 nt13.87□□□□□ -0.19
TRM3Q07527 FCY21YER060W 1587 nt13.85□□□□□ -0.19
TRM3Q07527 YCL074WYCL074W 927 nt13.82□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 QDR2YIL121W 1629 nt13.82□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 ARP6YLR085C 1317 nt13.82□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 DIF1YLR437C 402 nt13.81□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 CCT5YJR064W 1689 nt13.81□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 TAF13YML098W 504 nt13.81□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 SWE1YJL187C 2460 nt13.8□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 UGA4YDL210W 1716 nt13.8□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 YIA6YIL006W 1122 nt13.8□□□□□ -0.2
TRM3Q07527 MTG2YHR168W 1557 nt13.76□□□□□ -0.21
TRM3Q07527 HSP60YLR259C 1719 nt13.75□□□□□ -0.21
TRM3Q07527 RTN2YDL204W 1182 nt13.74□□□□□ -0.21
TRM3Q07527 POP2YNR052C 1302 nt13.74□□□□□ -0.21
TRM3Q07527 PAR32YDL173W 888 nt13.73□□□□□ -0.21
TRM3Q07527 PLB1YMR008C 1995 nt13.7□□□□□ -0.22
TRM3Q07527 YMR262WYMR262W 942 nt13.69□□□□□ -0.22
TRM3Q07527 BMT6YLR063W 1098 nt13.67□□□□□ -0.22
TRM3Q07527 SED1YDR077W 1017 nt13.64□□□□□ -0.23
TRM3Q07527 YER152W-AYER152W-A 567 nt13.62□□□□□ -0.23
TRM3Q07527 TUB4YLR212C 1422 nt13.59□□□□□ -0.23
TRM3Q07527 YJL118WYJL118W 660 nt13.58□□□□□ -0.24
TRM3Q07527 UTR1YJR049C 1593 nt13.57□□□□□ -0.24
TRM3Q07527 LSB5YCL034W 1065 nt13.57□□□□□ -0.24
TRM3Q07527 GSF2YML048W 1212 nt13.54□□□□□ -0.24
TRM3Q07527 MEP3YPR138C 1470 nt13.53□□□□□ -0.24
TRM3Q07527 YCP4YCR004C 744 nt13.52□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 GAL3YDR009W 1563 nt13.52□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 YER190C-AYER190C-A 576 nt13.51□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt13.51□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 APS2YJR058C 444 nt13.51□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 YML133W-AYML133W-A 576 nt13.51□□□□□ -0.25
TRM3Q07527 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt13.51□□□□□ -0.25
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