Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 RAD23YEL037C 1197 nt11.43□□□□□ -0.58
SUB2Q07478 BSP1YPR171W 1731 nt11.42□□□□□ -0.58
SUB2Q07478 RPS14BYJL191W 417 nt11.41□□□□□ -0.58
SUB2Q07478 DUT1YBR252W 444 nt11.41□□□□□ -0.58
SUB2Q07478 UTH1YKR042W 1098 nt11.4□□□□□ -0.58
SUB2Q07478 AGP1YCL025C 1902 nt11.38□□□□□ -0.59
SUB2Q07478 TIR3YIL011W 810 nt11.36□□□□□ -0.59
SUB2Q07478 TSC10YBR265W 963 nt11.35□□□□□ -0.59
SUB2Q07478 CCA1YER168C 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
SUB2Q07478 URH1YDR400W 1023 nt11.32□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 RAD51YER095W 1203 nt11.32□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 NBP35YGL091C 987 nt11.32□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 TOM6YOR045W 186 nt11.32□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 SHH4YLR164W 507 nt11.31□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.31□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 YGR012WYGR012W 1182 nt11.3□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 PEX2YJL210W 816 nt11.3□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 STE4YOR212W 1272 nt11.3□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 NRT1YOR071C 1797 nt11.3□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 RIB3YDR487C 627 nt11.29□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 LCP5YER127W 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 DUS1YML080W 1272 nt11.29□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 YPL041CYPL041C 624 nt11.29□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 HIP1YGR191W 1812 nt11.28□□□□□ -0.6
SUB2Q07478 YML089CYML089C 369 nt11.27□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 MAS1YLR163C 1389 nt11.26□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 COG1YGL223C 1254 nt11.25□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 POM34YLR018C 900 nt11.25□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 YNR029CYNR029C 1290 nt11.25□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 MET28YIR017C 564 nt11.23□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 FUN14YAL008W 597 nt11.22□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 AQY2YLL052C 450 nt11.22□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 NAS6YGR232W 687 nt11.21□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 LSC2YGR244C 1284 nt11.21□□□□□ -0.61
SUB2Q07478 YLR349WYLR349W 507 nt11.2□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 ADH7YCR105W 1086 nt11.19□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 CAB5YDR196C 726 nt11.19□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 PRO1YDR300C 1287 nt11.19□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 YJL195CYJL195C 702 nt11.19□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 SWE1YJL187C 2460 nt11.18□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 ATG15YCR068W 1563 nt11.17□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 PAU15YIR041W 375 nt11.17□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.17□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 STR3YGL184C 1398 nt11.16□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 YLR122CYLR122C 378 nt11.15□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 YLR279WYLR279W 390 nt11.15□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 REG2YBR050C 1017 nt11.15□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 TIF6YPR016C 738 nt11.15□□□□□ -0.62
SUB2Q07478 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.14□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 FIT3YOR383C 615 nt11.14□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 YJL225CYJL225C 5277 nt11.14□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 YJL118WYJL118W 660 nt11.13□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 ARA2YMR041C 1008 nt11.12□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 ADH1YOL086C 1047 nt11.1□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 MCM5YLR274W 2328 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 MSB4YOL112W 1479 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 FTH1YBR207W 1398 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 YCL074WYCL074W 927 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 YPI1YFR003C 468 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 TOM20YGR082W 552 nt11.09□□□□□ -0.63
SUB2Q07478 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
SUB2Q07478 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
SUB2Q07478 GPN2YOR262W 1044 nt11.04□□□□□ -0.64
SUB2Q07478 SSN3YPL042C 1668 nt11.04□□□□□ -0.64
SUB2Q07478 YDR306CYDR306C 1437 nt11.02□□□□□ -0.64
SUB2Q07478 PUS7YOR243C 2031 nt11.02□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 GAP1YKR039W 1809 nt11.02□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 GND1YHR183W 1470 nt11.01□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 YEL008WYEL008W 381 nt11.01□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 LOT5YKL183W 921 nt11.01□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 ARP6YLR085C 1317 nt11□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 CPD1YGR247W 720 nt10.98□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 FAF1YIL019W 1041 nt10.97□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.96□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 AAC1YMR056C 930 nt10.96□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 YTH1YPR107C 627 nt10.96□□□□□ -0.65
SUB2Q07478 UME6YDR207C 2511 nt10.94□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 ALP1YNL270C 1722 nt10.93□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 ESS1YJR017C 513 nt10.92□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 RTN2YDL204W 1182 nt10.91□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 APT2YDR441C 546 nt10.9□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 PLB1YMR008C 1995 nt10.9□□□□□ -0.66
SUB2Q07478 YAR028WYAR028W 705 nt10.89□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 SMM1YNR015W 1155 nt10.87□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 PUS5YLR165C 765 nt10.85□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 FHN1YGR131W 525 nt10.84□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 AKR2YOR034C 2250 nt10.84□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
SUB2Q07478 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.83□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 DIF1YLR437C 402 nt10.83□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 ZTA1YBR046C 1005 nt10.82□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 MTG2YHR168W 1557 nt10.82□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 ABZ2YMR289W 1125 nt10.81□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 FUR4YBR021W 1902 nt10.79□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 RIB2YOL066C 1776 nt10.79□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 NAP1YKR048C 1254 nt10.78□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 FCY21YER060W 1587 nt10.77□□□□□ -0.68
SUB2Q07478 SEN2YLR105C 1134 nt10.77□□□□□ -0.69
SUB2Q07478 UTR1YJR049C 1593 nt10.75□□□□□ -0.69
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