Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YJL067WYJL067W 351 nt9.4□□□□□ -0.9
YMR226CQ05016 VPS75YNL246W 795 nt9.39□□□□□ -0.91
YMR226CQ05016 HOL1YNR055C 1761 nt9.37□□□□□ -0.91
YMR226CQ05016 PRO1YDR300C 1287 nt9.36□□□□□ -0.91
YMR226CQ05016 DBP1YPL119C 1854 nt9.34□□□□□ -0.91
YMR226CQ05016 YFL066CYFL066C 1179 nt9.33□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 POM34YLR018C 900 nt9.33□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 SHH4YLR164W 507 nt9.33□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 ILV3YJR016C 1758 nt9.32□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 HXT1YHR094C 1713 nt9.32□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 MRPL8YJL063C 717 nt9.32□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 YML089CYML089C 369 nt9.32□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 ADO1YJR105W 1023 nt9.31□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 ATG15YCR068W 1563 nt9.31□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 DIF1YLR437C 402 nt9.29□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 YNL024CYNL024C 741 nt9.28□□□□□ -0.92
YMR226CQ05016 SHY1YGR112W 1170 nt9.27□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 FRE6YLL051C 2139 nt9.26□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 YFR018CYFR018C 1092 nt9.24□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.24□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 MAE1YKL029C 2010 nt9.22□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 YOR325WYOR325W 474 nt9.22□□□□□ -0.93
YMR226CQ05016 PAU7YAR020C 168 nt9.2□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 PRE6YOL038W 765 nt9.2□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 YDR010CYDR010C 333 nt9.19□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 HIS2YFR025C 1008 nt9.19□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 SFA1YDL168W 1161 nt9.18□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 RET2YFR051C 1641 nt9.18□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 URA6YKL024C 615 nt9.18□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 OPI10YOL032W 741 nt9.18□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 YBL086CYBL086C 1401 nt9.17□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 LIP1YMR298W 453 nt9.17□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 COQ8YGL119W 1506 nt9.16□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.16□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 SHB17YKR043C 816 nt9.16□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 TOM6YOR045W 186 nt9.16□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 CWC15YDR163W 528 nt9.15□□□□□ -0.94
YMR226CQ05016 SED1YDR077W 1017 nt9.14□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 YAR028WYAR028W 705 nt9.14□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 MRP20YDR405W 792 nt9.13□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 TIF6YPR016C 738 nt9.12□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 CCT2YIL142W 1584 nt9.12□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 UGP1YKL035W 1500 nt9.11□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 YMR209CYMR209C 1374 nt9.11□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 ARO8YGL202W 1503 nt9.1□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 UFO1YML088W 2007 nt9.09□□□□□ -0.95
YMR226CQ05016 ACO2YJL200C 2370 nt9.08□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 LEU9YOR108W 1815 nt9.08□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 SAM1YLR180W 1149 nt9.08□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 KES1YPL145C 1305 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 PET8YNL003C 855 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.07□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 MIR1YJR077C 936 nt9.06□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 HIP1YGR191W 1812 nt9.05□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 SGA1YIL099W 1650 nt9.05□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 PEX2YJL210W 816 nt9.05□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 OYE3YPL171C 1203 nt9.05□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 UBA4YHR111W 1323 nt9.04□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 MTG2YHR168W 1557 nt9.03□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 PHO89YBR296C 1725 nt9.03□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 MET28YIR017C 564 nt9.03□□□□□ -0.96
YMR226CQ05016 TOA2YKL058W 369 nt9.02□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 BET2YPR176C 978 nt9.02□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 BRR1YPR057W 1026 nt9.01□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 LSB6YJL100W 1824 nt9.01□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 RRT5YFR032C 870 nt9□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 SSN3YPL042C 1668 nt9□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 COQ2YNR041C 1119 nt8.99□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 MET2YNL277W 1461 nt8.99□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.98□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 YPL251WYPL251W 303 nt8.98□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 YRF1-2YER190W 5046 nt8.98□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 ALP1YNL270C 1722 nt8.97□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 PSD1YNL169C 1503 nt8.96□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 AKR2YOR034C 2250 nt8.96□□□□□ -0.97
YMR226CQ05016 YSR3YKR053C 1215 nt8.96□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 CYT1YOR065W 930 nt8.96□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 GND2YGR256W 1479 nt8.96□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 ZAP1YJL056C 2643 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 YDR094WYDR094W 336 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 SPP2YOR148C 558 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 FIT3YOR383C 615 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 VPS62YGR141W 1404 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 ACH1YBL015W 1581 nt8.95□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 THI74YDR438W 1113 nt8.94□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 FMS1YMR020W 1527 nt8.94□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 NRT1YOR071C 1797 nt8.94□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 YDL086WYDL086W 822 nt8.93□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 DMA2YNL116W 1569 nt8.93□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 RSC8YFR037C 1674 nt8.92□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 YCR087WYCR087W 516 nt8.92□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 ZTA1YBR046C 1005 nt8.92□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 QDR2YIL121W 1629 nt8.91□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 UTH1YKR042W 1098 nt8.91□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 YHL008CYHL008C 1884 nt8.9□□□□□ -0.98
YMR226CQ05016 DIG1YPL049C 1359 nt8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52 ms