Protein–RNA interactions for Protein: Q04264

PDS5, Sister chromatid cohesion protein PDS5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDS5Q04264 LSC2YGR244C 1284 nt13.19□□□□□ -0.3
PDS5Q04264 PEX2YJL210W 816 nt13.17□□□□□ -0.3
PDS5Q04264 BMT6YLR063W 1098 nt13.16□□□□□ -0.3
PDS5Q04264 ATG15YCR068W 1563 nt13.14□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 GAP1YKR039W 1809 nt13.13□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 YML089CYML089C 369 nt13.11□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 HIP1YGR191W 1812 nt13.11□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 YJL225CYJL225C 5277 nt13.1□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 GLR1YPL091W 1452 nt13.1□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 RPL4BYDR012W 1089 nt13.09□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 YMR244WYMR244W 1068 nt13.09□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 RPL4AYBR031W 1089 nt13.09□□□□□ -0.31
PDS5Q04264 SNF1YDR477W 1902 nt13.08□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 AAC1YMR056C 930 nt13.07□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 TIF6YPR016C 738 nt13.07□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 RPS14BYJL191W 417 nt13.05□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 IRC24YIR036C 792 nt13.04□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 UTR1YJR049C 1593 nt13.03□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 CLB6YGR109C 1143 nt13.03□□□□□ -0.32
PDS5Q04264 UTH1YKR042W 1098 nt13.01□□□□□ -0.33
PDS5Q04264 NRT1YOR071C 1797 nt13□□□□□ -0.33
PDS5Q04264 PRM5YIL117C 957 nt12.97□□□□□ -0.33
PDS5Q04264 MET28YIR017C 564 nt12.97□□□□□ -0.33
PDS5Q04264 DIF1YLR437C 402 nt12.93□□□□□ -0.34
PDS5Q04264 BIO5YNR056C 1686 nt12.92□□□□□ -0.34
PDS5Q04264 SDH5YOL071W 489 nt12.91□□□□□ -0.34
PDS5Q04264 ALG12YNR030W 1656 nt12.89□□□□□ -0.35
PDS5Q04264 RBG2YGR173W 1107 nt12.84□□□□□ -0.35
PDS5Q04264 TSC10YBR265W 963 nt12.84□□□□□ -0.35
PDS5Q04264 YGR012WYGR012W 1182 nt12.83□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 CAB5YDR196C 726 nt12.81□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 YLR279WYLR279W 390 nt12.81□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 ZTA1YBR046C 1005 nt12.81□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 YLR111WYLR111W 333 nt12.8□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 YAR028WYAR028W 705 nt12.8□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 MTG2YHR168W 1557 nt12.79□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 FIT3YOR383C 615 nt12.79□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 YMR226CYMR226C 804 nt12.78□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 ALD4YOR374W 1560 nt12.77□□□□□ -0.36
PDS5Q04264 SAM35YHR083W 990 nt12.77□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 HIF1YLL022C 1158 nt12.77□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 MSB4YOL112W 1479 nt12.77□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 RAD23YEL037C 1197 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.75□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 AKR2YOR034C 2250 nt12.74□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 ALP1YNL270C 1722 nt12.72□□□□□ -0.37
PDS5Q04264 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.68□□□□□ -0.38
PDS5Q04264 DBP1YPL119C 1854 nt12.67□□□□□ -0.38
PDS5Q04264 RIB3YDR487C 627 nt12.65□□□□□ -0.38
PDS5Q04264 SED1YDR077W 1017 nt12.64□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 LIP1YMR298W 453 nt12.63□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 PBP1YGR178C 2169 nt12.63□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.62□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 HXT1YHR094C 1713 nt12.62□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 YBL086CYBL086C 1401 nt12.59□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 NAR1YNL240C 1476 nt12.59□□□□□ -0.39
PDS5Q04264 YPL251WYPL251W 303 nt12.56□□□□□ -0.4
PDS5Q04264 UGA4YDL210W 1716 nt12.54□□□□□ -0.4
PDS5Q04264 UME6YDR207C 2511 nt12.52□□□□□ -0.4
PDS5Q04264 CYT2YKL087C 675 nt12.51□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 SHY1YGR112W 1170 nt12.5□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 BRR1YPR057W 1026 nt12.5□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 LEU9YOR108W 1815 nt12.49□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 GND1YHR183W 1470 nt12.49□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 FCY21YER060W 1587 nt12.48□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 TOA2YKL058W 369 nt12.48□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 SAM1YLR180W 1149 nt12.48□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 SMM1YNR015W 1155 nt12.48□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 LOT5YKL183W 921 nt12.47□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 YMR103CYMR103C 363 nt12.47□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 MCH5YOR306C 1566 nt12.47□□□□□ -0.41
PDS5Q04264 MEP3YPR138C 1470 nt12.45□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 APT2YDR441C 546 nt12.43□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 ZRT3YKL175W 1512 nt12.42□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 GND2YGR256W 1479 nt12.42□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 UFO1YML088W 2007 nt12.4□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.4□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.4□□□□□ -0.42
PDS5Q04264 PRY1YJL079C 900 nt12.38□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 YJL067WYJL067W 351 nt12.35□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 YPI1YFR003C 468 nt12.34□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 TRT2tT(CGU)K 72 nt12.34□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 ADH1YOL086C 1047 nt12.34□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 YAT1YAR035W 2064 nt12.34□□□□□ -0.43
PDS5Q04264 URA6YKL024C 615 nt12.33□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 YNR029CYNR029C 1290 nt12.33□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 OYE3YPL171C 1203 nt12.3□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.3□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 SSN3YPL042C 1668 nt12.29□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 CSM1YCR086W 573 nt12.29□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 RIB2YOL066C 1776 nt12.28□□□□□ -0.44
PDS5Q04264 YJL055WYJL055W 738 nt12.27□□□□□ -0.45
PDS5Q04264 BNI5YNL166C 1347 nt12.26□□□□□ -0.45
PDS5Q04264 VRG4YGL225W 1014 nt12.24□□□□□ -0.45
PDS5Q04264 YJL195CYJL195C 702 nt12.24□□□□□ -0.45
PDS5Q04264 PET8YNL003C 855 nt12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.2 ms