Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 ARP6YLR085C 1317 nt9.1□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 PLB1YMR008C 1995 nt9.1□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 CYT2YKL087C 675 nt9.1□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 GNP1YDR508C 1992 nt9.09□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 NPP1YCR026C 2229 nt9.09□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 YAT1YAR035W 2064 nt9.09□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 TIR3YIL011W 810 nt9.08□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 YDR094WYDR094W 336 nt9.06□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 LSC2YGR244C 1284 nt9.05□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 SAM35YHR083W 990 nt9.05□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 PRE6YOL038W 765 nt9.05□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 CMP2YML057W 1815 nt9.05□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 GAL2YLR081W 1725 nt9.04□□□□□ -0.96
SPC19Q03954 SHB17YKR043C 816 nt9.02□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 GAP1YKR039W 1809 nt9.01□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 PRM5YIL117C 957 nt9□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 ALD4YOR374W 1560 nt8.99□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 ATG15YCR068W 1563 nt8.99□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 PRO1YDR300C 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 YML089CYML089C 369 nt8.98□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 RFC1YOR217W 2586 nt8.98□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.97□□□□□ -0.97
SPC19Q03954 YDR010CYDR010C 333 nt8.96□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 MIR1YJR077C 936 nt8.96□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 UTR1YJR049C 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 SFP1YLR403W 2052 nt8.95□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 RET2YFR051C 1641 nt8.95□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 SHH4YLR164W 507 nt8.95□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 PAU16YKL224C 372 nt8.94□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 HIF1YLL022C 1158 nt8.94□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 PHO89YBR296C 1725 nt8.94□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 POM34YLR018C 900 nt8.93□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 UBA4YHR111W 1323 nt8.93□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 THI74YDR438W 1113 nt8.92□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 YSR3YKR053C 1215 nt8.92□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 YCR087WYCR087W 516 nt8.91□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 NAT4YMR069W 858 nt8.91□□□□□ -0.98
SPC19Q03954 SFA1YDL168W 1161 nt8.89□□□□□ -0.99
SPC19Q03954 TOM6YOR045W 186 nt8.89□□□□□ -0.99
SPC19Q03954 NDI1YML120C 1542 nt8.89□□□□□ -0.99
SPC19Q03954 MRP20YDR405W 792 nt8.88□□□□□ -0.99
SPC19Q03954 YMR244WYMR244W 1068 nt8.84□□□□□ -0.99
SPC19Q03954 MSF1YPR047W 1410 nt8.83□□□□□ -1
SPC19Q03954 PEX2YJL210W 816 nt8.83□□□□□ -1
SPC19Q03954 ZRT3YKL175W 1512 nt8.82□□□□□ -1
SPC19Q03954 CLB6YGR109C 1143 nt8.82□□□□□ -1
SPC19Q03954 DIF1YLR437C 402 nt8.82□□□□□ -1
SPC19Q03954 INA1YLR413W 2028 nt8.81□□□□□ -1
SPC19Q03954 COQ2YNR041C 1119 nt8.8□□□□□ -1
SPC19Q03954 TOK1YJL093C 2076 nt8.8□□□□□ -1
SPC19Q03954 HXT1YHR094C 1713 nt8.8□□□□□ -1
SPC19Q03954 FRA1YLL029W 2250 nt8.79□□□□□ -1
SPC19Q03954 MET28YIR017C 564 nt8.79□□□□□ -1
SPC19Q03954 HSL7YBR133C 2484 nt8.79□□□□□ -1
SPC19Q03954 UTH1YKR042W 1098 nt8.78□□□□□ -1
SPC19Q03954 XYL2YLR070C 1071 nt8.78□□□□□ -1
SPC19Q03954 YAR028WYAR028W 705 nt8.78□□□□□ -1
SPC19Q03954 TIF6YPR016C 738 nt8.78□□□□□ -1
SPC19Q03954 GTB1YDR221W 2109 nt8.78□□□□□ -1
SPC19Q03954 RPL4BYDR012W 1089 nt8.77□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 RPL4AYBR031W 1089 nt8.77□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 HIP1YGR191W 1812 nt8.77□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 NRT1YOR071C 1797 nt8.76□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 YGL034CYGL034C 366 nt8.76□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 AIM45YPR004C 1035 nt8.76□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 SED1YDR077W 1017 nt8.74□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 AAC3YBR085W 924 nt8.74□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 SPT20YOL148C 1815 nt8.73□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 LIP1YMR298W 453 nt8.73□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 HEL2YDR266C 1920 nt8.73□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 NSG2YNL156C 900 nt8.72□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 FIT3YOR383C 615 nt8.72□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 NME1NME1 340 nt8.72□□□□□ -1.01
SPC19Q03954 DBP1YPL119C 1854 nt8.7□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.69□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.69□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 AKR2YOR034C 2250 nt8.69□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 HXT10YFL011W 1641 nt8.69□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 SAM1YLR180W 1149 nt8.68□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 ALP1YNL270C 1722 nt8.66□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 RBG1YAL036C 1110 nt8.66□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 SHY1YGR112W 1170 nt8.65□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 RPS14BYJL191W 417 nt8.65□□□□□ -1.02
SPC19Q03954 YJL067WYJL067W 351 nt8.64□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 RPC82YPR190C 1965 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 TOA2YKL058W 369 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 MTG2YHR168W 1557 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 YBL086CYBL086C 1401 nt8.63□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 SDH5YOL071W 489 nt8.62□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 MET8YBR213W 825 nt8.59□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 TSC10YBR265W 963 nt8.59□□□□□ -1.03
SPC19Q03954 CWC15YDR163W 528 nt8.58□□□□□ -1.04
SPC19Q03954 NAS6YGR232W 687 nt8.58□□□□□ -1.04
SPC19Q03954 URA6YKL024C 615 nt8.58□□□□□ -1.04
SPC19Q03954 ZTA1YBR046C 1005 nt8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms