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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
ALG3
YBL082C
1377 nt
6.77
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
HHO1
YPL127C
777 nt
6.76
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
ALR1
YOL130W
2580 nt
6.76
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
YDR306C
YDR306C
1437 nt
6.76
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
YHR218W
YHR218W
1812 nt
6.75
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
MDL2
YPL270W
2322 nt
6.75
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
XDJ1
YLR090W
1380 nt
6.74
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
YGR201C
YGR201C
678 nt
6.73
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
DUR3
YHL016C
2208 nt
6.73
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
TAD3
YLR316C
969 nt
6.72
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
FRD1
YEL047C
1413 nt
6.72
□□□□□ -1.33
COF1
Q03048
YJL067W
YJL067W
351 nt
6.71
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
MAM3
YOL060C
2121 nt
6.71
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
FMP45
YDL222C
930 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
SPC25
YER018C
666 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
DIC1
YLR348C
897 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
YOR325W
YOR325W
474 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
MEX67
YPL169C
1800 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
RSC8
YFR037C
1674 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
SGA1
YIL099W
1650 nt
6.7
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
YDR433W
YDR433W
441 nt
6.69
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
OPI10
YOL032W
741 nt
6.69
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
YOR139C
YOR139C
393 nt
6.69
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
ARO8
YGL202W
1503 nt
6.68
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
YIL100C-A
YIL100C-A
339 nt
6.68
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
ERV46
YAL042W
1248 nt
6.68
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
AQY2
YLL052C
450 nt
6.68
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
MXR2
YCL033C
507 nt
6.68
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
FEN2
YCR028C
1539 nt
6.67
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
PRM5
YIL117C
957 nt
6.67
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
KES1
YPL145C
1305 nt
6.67
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
STB1
YNL309W
1263 nt
6.66
□□□□□ -1.34
COF1
Q03048
LPD1
YFL018C
1500 nt
6.65
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
6.64
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
YKR040C
YKR040C
504 nt
6.64
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
ECM10
YEL030W
1935 nt
6.62
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
ZAP1
YJL056C
2643 nt
6.62
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
YIR016W
YIR016W
798 nt
6.62
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
UFD1
YGR048W
1086 nt
6.61
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
DAK2
YFL053W
1776 nt
6.6
□□□□□ -1.35
COF1
Q03048
PLB1
YMR008C
1995 nt
6.58
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
NBA1
YOL070C
1506 nt
6.57
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
PUS2
YGL063W
1113 nt
6.57
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
ODC1
YPL134C
933 nt
6.57
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
FIT1
YDR534C
1587 nt
6.57
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
YEL023C
YEL023C
2049 nt
6.56
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
VPS60
YDR486C
690 nt
6.56
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
CCT2
YIL142W
1584 nt
6.56
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
DUT1
YBR252W
444 nt
6.55
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
CCT4
YDL143W
1587 nt
6.55
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
ADE5,7
YGL234W
2409 nt
6.55
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
PUS7
YOR243C
2031 nt
6.54
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
LSB5
YCL034W
1065 nt
6.54
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
YPR011C
YPR011C
981 nt
6.53
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
BET2
YPR176C
978 nt
6.53
□□□□□ -1.36
COF1
Q03048
YIL177C
YIL177C
5277 nt
6.52
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
STF1
YDL130W-A
261 nt
6.52
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
SAM35
YHR083W
990 nt
6.52
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
GOR1
YNL274C
1053 nt
6.52
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
ARP6
YLR085C
1317 nt
6.51
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
AHT1
YHR093W
549 nt
6.51
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
MDM35
YKL053C-A
261 nt
6.5
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
TIM23
YNR017W
669 nt
6.5
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
HXT10
YFL011W
1641 nt
6.5
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
YJL045W
YJL045W
1905 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
LSB6
YJL100W
1824 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
IMT4
tM(CAU)E
72 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
6.49
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
YMR244W
YMR244W
1068 nt
6.48
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
MIM1
YOL026C
342 nt
6.48
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
AVT6
YER119C
1347 nt
6.48
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
YLR179C
YLR179C
606 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
YLR235C
YLR235C
399 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
SWC5
YBR231C
912 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
SSL2
YIL143C
2532 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
GUT1
YHL032C
2130 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
QDR2
YIL121W
1629 nt
6.47
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
MET30
YIL046W
1923 nt
6.46
□□□□□ -1.37
COF1
Q03048
YNL190W
YNL190W
615 nt
6.46
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
DAT1
YML113W
747 nt
6.44
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
UTR1
YJR049C
1593 nt
6.44
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
HBS1
YKR084C
1836 nt
6.43
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
YRF1-1
YDR545W
5391 nt
6.42
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
YRF1-5
YLR467W
5391 nt
6.42
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
YRF1-8
YOR396W
5391 nt
6.42
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
CWC15
YDR163W
528 nt
6.42
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)B
tD(GUC)B
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)D
tD(GUC)D
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)G1
tD(GUC)G1
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)G2
tD(GUC)G2
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)I1
tD(GUC)I1
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)I2
tD(GUC)I2
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)J1
tD(GUC)J1
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)J2
tD(GUC)J2
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)J3
tD(GUC)J3
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)J4
tD(GUC)J4
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)K
tD(GUC)K
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
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