Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

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Length 1,223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 YMR244WYMR244W 1068 nt11.37□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 NDI1YML120C 1542 nt11.35□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 GLR1YPL091W 1452 nt11.34□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 FRE6YLL051C 2139 nt11.34□□□□□ -0.59
GDE1Q02979 LSC2YGR244C 1284 nt11.33□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 BMT6YLR063W 1098 nt11.33□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 PRO1YDR300C 1287 nt11.32□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 POM34YLR018C 900 nt11.32□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 ARP6YLR085C 1317 nt11.32□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 DPS1YLL018C 1674 nt11.31□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 TOM6YOR045W 186 nt11.31□□□□□ -0.6
GDE1Q02979 PLB1YMR008C 1995 nt11.27□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 YML089CYML089C 369 nt11.27□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 ATG15YCR068W 1563 nt11.26□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 RPL4BYDR012W 1089 nt11.25□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 PEX2YJL210W 816 nt11.25□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 RPL4AYBR031W 1089 nt11.25□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 CLB6YGR109C 1143 nt11.24□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 GAP1YKR039W 1809 nt11.23□□□□□ -0.61
GDE1Q02979 HIP1YGR191W 1812 nt11.21□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 UTH1YKR042W 1098 nt11.2□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 AAC1YMR056C 930 nt11.19□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 IRC24YIR036C 792 nt11.17□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 RPS14BYJL191W 417 nt11.17□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 TIF6YPR016C 738 nt11.17□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 RBG2YGR173W 1107 nt11.15□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 NRT1YOR071C 1797 nt11.15□□□□□ -0.62
GDE1Q02979 MET28YIR017C 564 nt11.13□□□□□ -0.63
GDE1Q02979 UTR1YJR049C 1593 nt11.11□□□□□ -0.63
GDE1Q02979 SDH5YOL071W 489 nt11.11□□□□□ -0.63
GDE1Q02979 SNF1YDR477W 1902 nt11.09□□□□□ -0.63
GDE1Q02979 SSN3YPL042C 1668 nt11.08□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 PRM5YIL117C 957 nt11.05□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 YLR111WYLR111W 333 nt11.04□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 DIF1YLR437C 402 nt11.04□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 TSC10YBR265W 963 nt11.04□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 SAM35YHR083W 990 nt11.03□□□□□ -0.64
GDE1Q02979 YMR226CYMR226C 804 nt11.02□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 FIT3YOR383C 615 nt11.02□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 YAR028WYAR028W 705 nt10.99□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 YGR012WYGR012W 1182 nt10.98□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 ALG12YNR030W 1656 nt10.97□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 RAD23YEL037C 1197 nt10.96□□□□□ -0.65
GDE1Q02979 BIO5YNR056C 1686 nt10.95□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 YLR279WYLR279W 390 nt10.94□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 ALD4YOR374W 1560 nt10.93□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 AKR2YOR034C 2250 nt10.92□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 ALP1YNL270C 1722 nt10.92□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 MTG2YHR168W 1557 nt10.91□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 ZTA1YBR046C 1005 nt10.91□□□□□ -0.66
GDE1Q02979 MSB4YOL112W 1479 nt10.89□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 HIF1YLL022C 1158 nt10.88□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YGR139WYGR139W 339 nt10.87□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 SED1YDR077W 1017 nt10.85□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 RIB3YDR487C 627 nt10.85□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 CAB5YDR196C 726 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 SAM1YLR180W 1149 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 BSP1YPR171W 1731 nt10.84□□□□□ -0.67
GDE1Q02979 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.83□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.82□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 LIP1YMR298W 453 nt10.82□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 MCH5YOR306C 1566 nt10.81□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 HXT1YHR094C 1713 nt10.81□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 DBP1YPL119C 1854 nt10.8□□□□□ -0.68
GDE1Q02979 YBL086CYBL086C 1401 nt10.74□□□□□ -0.69
GDE1Q02979 NAR1YNL240C 1476 nt10.72□□□□□ -0.69
GDE1Q02979 GID7YCL039W 2238 nt10.7□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 YPL251WYPL251W 303 nt10.7□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 MET8YBR213W 825 nt10.7□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 PBP1YGR178C 2169 nt10.7□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 GND1YHR183W 1470 nt10.69□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 LOT5YKL183W 921 nt10.69□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 TOA2YKL058W 369 nt10.68□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 BRR1YPR057W 1026 nt10.68□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 UGA4YDL210W 1716 nt10.67□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 CYT2YKL087C 675 nt10.67□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 FCY21YER060W 1587 nt10.67□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 LEU9YOR108W 1815 nt10.66□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 SHY1YGR112W 1170 nt10.66□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 MEP3YPR138C 1470 nt10.66□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 ZRT3YKL175W 1512 nt10.65□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 SMM1YNR015W 1155 nt10.65□□□□□ -0.7
GDE1Q02979 YMR103CYMR103C 363 nt10.64□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 APT2YDR441C 546 nt10.63□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 RAD51YER095W 1203 nt10.63□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 YPI1YFR003C 468 nt10.61□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 GND2YGR256W 1479 nt10.6□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 PRY1YJL079C 900 nt10.59□□□□□ -0.71
GDE1Q02979 ESBP6YNL125C 2022 nt10.57□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.57□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 UFO1YML088W 2007 nt10.57□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.56□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 YJL195CYJL195C 702 nt10.55□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 URA6YKL024C 615 nt10.55□□□□□ -0.72
GDE1Q02979 STE4YOR212W 1272 nt10.55□□□□□ -0.72
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