Protein–RNA interactions for Protein: Q02648

TRM44, tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM44Q02648 DUT1YBR252W 444 nt11.69□□□□□ -0.54
TRM44Q02648 TIR3YIL011W 810 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM44Q02648 ESS1YJR017C 513 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM44Q02648 TOM6YOR045W 186 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM44Q02648 HIP1YGR191W 1812 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM44Q02648 GPN2YOR262W 1044 nt11.64□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 NBP35YGL091C 987 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 PEX2YJL210W 816 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 NRT1YOR071C 1797 nt11.62□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 AGP1YCL025C 1902 nt11.62□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 YEL008WYEL008W 381 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 CPD1YGR247W 720 nt11.6□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 POM34YLR018C 900 nt11.59□□□□□ -0.55
TRM44Q02648 PTK1YKL198C 1989 nt11.58□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 YPI1YFR003C 468 nt11.58□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.57□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 MSB4YOL112W 1479 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 YML089CYML089C 369 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 MET28YIR017C 564 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 TIF6YPR016C 738 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM44Q02648 PUP1YOR157C 786 nt11.5□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 LSC2YGR244C 1284 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 NAP1YKR048C 1254 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 CCA1YER168C 1641 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 PRO1YDR300C 1287 nt11.47□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 SEN2YLR105C 1134 nt11.46□□□□□ -0.57
TRM44Q02648 GND1YHR183W 1470 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 LOT5YKL183W 921 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 FIT3YOR383C 615 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 AAC1YMR056C 930 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 YFL054CYFL054C 1941 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 ATG15YCR068W 1563 nt11.4□□□□□ -0.58
TRM44Q02648 STR3YGL184C 1398 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM44Q02648 APT2YDR441C 546 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM44Q02648 PGC1YPL206C 966 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM44Q02648 YBR232CYBR232C 360 nt11.31□□□□□ -0.6
TRM44Q02648 AQY2YLL052C 450 nt11.3□□□□□ -0.6
TRM44Q02648 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 ARP6YLR085C 1317 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 DUS1YML080W 1272 nt11.26□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 SMM1YNR015W 1155 nt11.26□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 YJR114WYJR114W 393 nt11.24□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 RIB2YOL066C 1776 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 SWE1YJL187C 2460 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 PAU5YFL020C 369 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 YJL064WYJL064W 396 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 GAP1YKR039W 1809 nt11.22□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 STP3YLR375W 1032 nt11.21□□□□□ -0.61
TRM44Q02648 FCY21YER060W 1587 nt11.2□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 ALP1YNL270C 1722 nt11.19□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 PAU19YMR325W 375 nt11.19□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 ZTA1YBR046C 1005 nt11.19□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 HXT12YIL170W 1374 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 TIM44YIL022W 1296 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 YJL225CYJL225C 5277 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 YCL074WYCL074W 927 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 YAR028WYAR028W 705 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM44Q02648 MTG2YHR168W 1557 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM44Q02648 ALD4YOR374W 1560 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM44Q02648 DIF1YLR437C 402 nt11.12□□□□□ -0.63
TRM44Q02648 SLG1YOR008C 1137 nt11.12□□□□□ -0.63
TRM44Q02648 AKR2YOR034C 2250 nt11.12□□□□□ -0.63
TRM44Q02648 PRY1YJL079C 900 nt11.08□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 CCT5YJR064W 1689 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 PLB1YMR008C 1995 nt11.05□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 VRG4YGL225W 1014 nt11.05□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 RIB1YBL033C 1038 nt11.05□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 RTN2YDL204W 1182 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 PAC11YDR488C 1602 nt11.02□□□□□ -0.64
TRM44Q02648 UGA4YDL210W 1716 nt10.98□□□□□ -0.65
TRM44Q02648 YJL055WYJL055W 738 nt10.98□□□□□ -0.65
TRM44Q02648 ERG6YML008C 1152 nt10.98□□□□□ -0.65
TRM44Q02648 TIP1YBR067C 633 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 UTR1YJR049C 1593 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 YIA6YIL006W 1122 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 TAF13YML098W 504 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 SOD2YHR008C 702 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 THI72YOR192C 1800 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM44Q02648 PAR32YDL173W 888 nt10.89□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 SED1YDR077W 1017 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 NVJ2YPR091C 2313 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 YMR262WYMR262W 942 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM44Q02648 CSM1YCR086W 573 nt10.83□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 HSP60YLR259C 1719 nt10.83□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 GAL3YDR009W 1563 nt10.82□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 POP2YNR052C 1302 nt10.8□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 TUB4YLR212C 1422 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 FUR4YBR021W 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 QDR2YIL121W 1629 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM44Q02648 YJL118WYJL118W 660 nt10.78□□□□□ -0.68
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