Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 ATG15YCR068W 1563 nt12.47□□□□□ -0.41
HEF3P53978 YMR244WYMR244W 1068 nt12.47□□□□□ -0.41
HEF3P53978 GLR1YPL091W 1452 nt12.46□□□□□ -0.42
HEF3P53978 GAP1YKR039W 1809 nt12.43□□□□□ -0.42
HEF3P53978 HIP1YGR191W 1812 nt12.42□□□□□ -0.42
HEF3P53978 LSC2YGR244C 1284 nt12.42□□□□□ -0.42
HEF3P53978 BMT6YLR063W 1098 nt12.42□□□□□ -0.42
HEF3P53978 SNF1YDR477W 1902 nt12.41□□□□□ -0.42
HEF3P53978 RPL4BYDR012W 1089 nt12.39□□□□□ -0.43
HEF3P53978 RPS14BYJL191W 417 nt12.39□□□□□ -0.43
HEF3P53978 RPL4AYBR031W 1089 nt12.39□□□□□ -0.43
HEF3P53978 TIF6YPR016C 738 nt12.38□□□□□ -0.43
HEF3P53978 YML089CYML089C 369 nt12.37□□□□□ -0.43
HEF3P53978 UTR1YJR049C 1593 nt12.36□□□□□ -0.43
HEF3P53978 NVJ2YPR091C 2313 nt12.34□□□□□ -0.43
HEF3P53978 AAC1YMR056C 930 nt12.33□□□□□ -0.44
HEF3P53978 PRM5YIL117C 957 nt12.32□□□□□ -0.44
HEF3P53978 UTH1YKR042W 1098 nt12.32□□□□□ -0.44
HEF3P53978 NRT1YOR071C 1797 nt12.32□□□□□ -0.44
HEF3P53978 CLB6YGR109C 1143 nt12.31□□□□□ -0.44
HEF3P53978 SDH5YOL071W 489 nt12.3□□□□□ -0.44
HEF3P53978 IRC24YIR036C 792 nt12.27□□□□□ -0.45
HEF3P53978 CAB5YDR196C 726 nt12.26□□□□□ -0.45
HEF3P53978 MET28YIR017C 564 nt12.26□□□□□ -0.45
HEF3P53978 DIF1YLR437C 402 nt12.24□□□□□ -0.45
HEF3P53978 BIO5YNR056C 1686 nt12.24□□□□□ -0.45
HEF3P53978 ZTA1YBR046C 1005 nt12.22□□□□□ -0.45
HEF3P53978 RBG2YGR173W 1107 nt12.21□□□□□ -0.45
HEF3P53978 YGR012WYGR012W 1182 nt12.18□□□□□ -0.46
HEF3P53978 YLR111WYLR111W 333 nt12.17□□□□□ -0.46
HEF3P53978 YLR279WYLR279W 390 nt12.17□□□□□ -0.46
HEF3P53978 TSC10YBR265W 963 nt12.16□□□□□ -0.46
HEF3P53978 MSB4YOL112W 1479 nt12.15□□□□□ -0.46
HEF3P53978 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 ALG12YNR030W 1656 nt12.13□□□□□ -0.47
HEF3P53978 AKR2YOR034C 2250 nt12.12□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YAR028WYAR028W 705 nt12.12□□□□□ -0.47
HEF3P53978 MTG2YHR168W 1557 nt12.12□□□□□ -0.47
HEF3P53978 HIF1YLL022C 1158 nt12.09□□□□□ -0.47
HEF3P53978 YMR226CYMR226C 804 nt12.07□□□□□ -0.48
HEF3P53978 FIT3YOR383C 615 nt12.07□□□□□ -0.48
HEF3P53978 RAD23YEL037C 1197 nt12.06□□□□□ -0.48
HEF3P53978 ALD4YOR374W 1560 nt12.05□□□□□ -0.48
HEF3P53978 SAM35YHR083W 990 nt12.04□□□□□ -0.48
HEF3P53978 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.04□□□□□ -0.48
HEF3P53978 ALP1YNL270C 1722 nt12.02□□□□□ -0.49
HEF3P53978 SED1YDR077W 1017 nt11.98□□□□□ -0.49
HEF3P53978 RIB3YDR487C 627 nt11.97□□□□□ -0.49
HEF3P53978 DBP1YPL119C 1854 nt11.96□□□□□ -0.49
HEF3P53978 LIP1YMR298W 453 nt11.96□□□□□ -0.49
HEF3P53978 YBL086CYBL086C 1401 nt11.95□□□□□ -0.5
HEF3P53978 HXT1YHR094C 1713 nt11.95□□□□□ -0.5
HEF3P53978 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.95□□□□□ -0.5
HEF3P53978 YPL251WYPL251W 303 nt11.94□□□□□ -0.5
HEF3P53978 UGA4YDL210W 1716 nt11.94□□□□□ -0.5
HEF3P53978 PBP1YGR178C 2169 nt11.91□□□□□ -0.5
HEF3P53978 NAR1YNL240C 1476 nt11.91□□□□□ -0.5
HEF3P53978 LOT5YKL183W 921 nt11.87□□□□□ -0.51
HEF3P53978 YMR103CYMR103C 363 nt11.86□□□□□ -0.51
HEF3P53978 TOA2YKL058W 369 nt11.85□□□□□ -0.51
HEF3P53978 SMM1YNR015W 1155 nt11.85□□□□□ -0.51
HEF3P53978 BRR1YPR057W 1026 nt11.85□□□□□ -0.51
HEF3P53978 GND1YHR183W 1470 nt11.84□□□□□ -0.51
HEF3P53978 APT2YDR441C 546 nt11.84□□□□□ -0.51
HEF3P53978 SHY1YGR112W 1170 nt11.84□□□□□ -0.51
HEF3P53978 SAM1YLR180W 1149 nt11.84□□□□□ -0.51
HEF3P53978 MEP3YPR138C 1470 nt11.83□□□□□ -0.52
HEF3P53978 FCY21YER060W 1587 nt11.81□□□□□ -0.52
HEF3P53978 MCH5YOR306C 1566 nt11.81□□□□□ -0.52
HEF3P53978 YJL225CYJL225C 5277 nt11.81□□□□□ -0.52
HEF3P53978 GND2YGR256W 1479 nt11.81□□□□□ -0.52
HEF3P53978 LEU9YOR108W 1815 nt11.79□□□□□ -0.52
HEF3P53978 CYT2YKL087C 675 nt11.79□□□□□ -0.52
HEF3P53978 PRY1YJL079C 900 nt11.78□□□□□ -0.52
HEF3P53978 UFO1YML088W 2007 nt11.76□□□□□ -0.53
HEF3P53978 YAT1YAR035W 2064 nt11.72□□□□□ -0.53
HEF3P53978 ADH1YOL086C 1047 nt11.72□□□□□ -0.53
HEF3P53978 YJL055WYJL055W 738 nt11.71□□□□□ -0.53
HEF3P53978 YNR029CYNR029C 1290 nt11.71□□□□□ -0.53
HEF3P53978 RIB2YOL066C 1776 nt11.7□□□□□ -0.54
HEF3P53978 ZRT3YKL175W 1512 nt11.7□□□□□ -0.54
HEF3P53978 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.69□□□□□ -0.54
HEF3P53978 YJL067WYJL067W 351 nt11.69□□□□□ -0.54
HEF3P53978 UME6YDR207C 2511 nt11.68□□□□□ -0.54
HEF3P53978 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.68□□□□□ -0.54
HEF3P53978 YPI1YFR003C 468 nt11.68□□□□□ -0.54
HEF3P53978 SSN3YPL042C 1668 nt11.68□□□□□ -0.54
HEF3P53978 OYE3YPL171C 1203 nt11.66□□□□□ -0.54
HEF3P53978 BNI5YNL166C 1347 nt11.65□□□□□ -0.54
HEF3P53978 CSM1YCR086W 573 nt11.65□□□□□ -0.54
HEF3P53978 RAD51YER095W 1203 nt11.65□□□□□ -0.54
HEF3P53978 YJL195CYJL195C 702 nt11.64□□□□□ -0.55
HEF3P53978 VRG4YGL225W 1014 nt11.63□□□□□ -0.55
HEF3P53978 URA6YKL024C 615 nt11.63□□□□□ -0.55
HEF3P53978 SAM2YDR502C 1155 nt11.6□□□□□ -0.55
HEF3P53978 Q0182Q0182 405 nt11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.1 ms