Protein–RNA interactions for Protein: P53749

YNR063W, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YNR063W, yeastyeast

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR063WP53749 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.19□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 PRP4YPR178W 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.19□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 AAC1YMR056C 930 nt10.19□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 TIR3YIL011W 810 nt10.18□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 AQY2YLL052C 450 nt10.18□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 SHH4YLR164W 507 nt10.18□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 PAU21YOR394W 495 nt10.18□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 PAU22YPL282C 495 nt10.18□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 MET8YBR213W 825 nt10.17□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 DPS1YLL018C 1674 nt10.16□□□□□ -0.78
YNR063WP53749 PBP1YGR178C 2169 nt10.12□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 BIO5YNR056C 1686 nt10.12□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 RPL4BYDR012W 1089 nt10.11□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 RPL4AYBR031W 1089 nt10.11□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 RBG2YGR173W 1107 nt10.1□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 POM34YLR018C 900 nt10.1□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 LSC2YGR244C 1284 nt10.09□□□□□ -0.79
YNR063WP53749 SNF1YDR477W 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 CLB6YGR109C 1143 nt10.08□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 TOM6YOR045W 186 nt10.08□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 YKR005CYKR005C 1578 nt10.06□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 YML089CYML089C 369 nt10.06□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 YMR226CYMR226C 804 nt10.06□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 PRO1YDR300C 1287 nt10.05□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 RPS14BYJL191W 417 nt10.05□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 ARO7YPR060C 771 nt10.05□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 HIP1YGR191W 1812 nt10.05□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 ARP6YLR085C 1317 nt10.05□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 PEX2YJL210W 816 nt10.03□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 CYT2YKL087C 675 nt10.03□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 UTH1YKR042W 1098 nt10.03□□□□□ -0.8
YNR063WP53749 RTN2YDL204W 1182 nt10.01□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 BMT6YLR063W 1098 nt10.01□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 ATG15YCR068W 1563 nt9.99□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 YGR259CYGR259C 441 nt9.98□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 TIF6YPR016C 738 nt9.98□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 NRT1YOR071C 1797 nt9.97□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 YLR111WYLR111W 333 nt9.97□□□□□ -0.81
YNR063WP53749 SDH5YOL071W 489 nt9.96□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 HSL7YBR133C 2484 nt9.96□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 GAP1YKR039W 1809 nt9.96□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 PLB1YMR008C 1995 nt9.95□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 MET28YIR017C 564 nt9.95□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 BSP1YPR171W 1731 nt9.95□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 TSC10YBR265W 963 nt9.94□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 RAD23YEL037C 1197 nt9.92□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 IRC24YIR036C 792 nt9.9□□□□□ -0.82
YNR063WP53749 YGR012WYGR012W 1182 nt9.89□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 FIT3YOR383C 615 nt9.87□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 SSN3YPL042C 1668 nt9.87□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 CMP2YML057W 1815 nt9.86□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.84□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.84□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 YLR279WYLR279W 390 nt9.84□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.84□□□□□ -0.83
YNR063WP53749 CAB5YDR196C 726 nt9.82□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 RIB3YDR487C 627 nt9.82□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 SAM1YLR180W 1149 nt9.82□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 UTR1YJR049C 1593 nt9.81□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 DIF1YLR437C 402 nt9.81□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 YAT1YAR035W 2064 nt9.79□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 MSB4YOL112W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 YAR028WYAR028W 705 nt9.78□□□□□ -0.84
YNR063WP53749 ALP1YNL270C 1722 nt9.75□□□□□ -0.85
YNR063WP53749 MTG2YHR168W 1557 nt9.74□□□□□ -0.85
YNR063WP53749 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.73□□□□□ -0.85
YNR063WP53749 SAM35YHR083W 990 nt9.71□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 ZTA1YBR046C 1005 nt9.71□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 REG2YBR050C 1017 nt9.71□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.7□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 PRM5YIL117C 957 nt9.7□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 HEL2YDR266C 1920 nt9.7□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 AKR2YOR034C 2250 nt9.69□□□□□ -0.86
YNR063WP53749 GND1YHR183W 1470 nt9.65□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.63□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 SED1YDR077W 1017 nt9.62□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YJR154WYJR154W 1041 nt9.62□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 Q0010Q0010 387 nt9.62□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 LOT5YKL183W 921 nt9.61□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YPI1YFR003C 468 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.6□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 FCY21YER060W 1587 nt9.59□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 ADH1YOL086C 1047 nt9.59□□□□□ -0.87
YNR063WP53749 SPT20YOL148C 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 ALD4YOR374W 1560 nt9.58□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 DBP1YPL119C 1854 nt9.57□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 LIP1YMR298W 453 nt9.57□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 YJL195CYJL195C 702 nt9.56□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 HIF1YLL022C 1158 nt9.56□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 SMM1YNR015W 1155 nt9.56□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 FUN14YAL008W 597 nt9.55□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 APT2YDR441C 546 nt9.54□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 YNR029CYNR029C 1290 nt9.54□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 STE4YOR212W 1272 nt9.53□□□□□ -0.88
YNR063WP53749 RPC82YPR190C 1965 nt9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms