Protein–RNA interactions for Protein: P45818

ROK1, ATP-dependent RNA helicase ROK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROK1P45818 YGR259CYGR259C 441 nt10.17□□□□□ -0.78
ROK1P45818 POM34YLR018C 900 nt10.15□□□□□ -0.78
ROK1P45818 RBG1YAL036C 1110 nt10.14□□□□□ -0.79
ROK1P45818 YML089CYML089C 369 nt10.14□□□□□ -0.79
ROK1P45818 NDI1YML120C 1542 nt10.12□□□□□ -0.79
ROK1P45818 BMT6YLR063W 1098 nt10.12□□□□□ -0.79
ROK1P45818 DPS1YLL018C 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
ROK1P45818 PRO1YDR300C 1287 nt10.1□□□□□ -0.79
ROK1P45818 TOM6YOR045W 186 nt10.1□□□□□ -0.79
ROK1P45818 RPL4BYDR012W 1089 nt10.09□□□□□ -0.79
ROK1P45818 RPL4AYBR031W 1089 nt10.09□□□□□ -0.79
ROK1P45818 PLB1YMR008C 1995 nt10.08□□□□□ -0.8
ROK1P45818 GLR1YPL091W 1452 nt10.07□□□□□ -0.8
ROK1P45818 CLB6YGR109C 1143 nt10.06□□□□□ -0.8
ROK1P45818 ATG15YCR068W 1563 nt10.05□□□□□ -0.8
ROK1P45818 GAP1YKR039W 1809 nt10.05□□□□□ -0.8
ROK1P45818 HIP1YGR191W 1812 nt10.05□□□□□ -0.8
ROK1P45818 IRC24YIR036C 792 nt10.03□□□□□ -0.8
ROK1P45818 PEX2YJL210W 816 nt10.03□□□□□ -0.8
ROK1P45818 UTH1YKR042W 1098 nt10.03□□□□□ -0.8
ROK1P45818 AAC1YMR056C 930 nt10.02□□□□□ -0.81
ROK1P45818 YMR244WYMR244W 1068 nt10.02□□□□□ -0.81
ROK1P45818 RPS14BYJL191W 417 nt10.01□□□□□ -0.81
ROK1P45818 TIF6YPR016C 738 nt10.01□□□□□ -0.81
ROK1P45818 MET28YIR017C 564 nt9.99□□□□□ -0.81
ROK1P45818 ALG12YNR030W 1656 nt9.97□□□□□ -0.81
ROK1P45818 NRT1YOR071C 1797 nt9.97□□□□□ -0.81
ROK1P45818 UTR1YJR049C 1593 nt9.93□□□□□ -0.82
ROK1P45818 SNF1YDR477W 1902 nt9.93□□□□□ -0.82
ROK1P45818 DIF1YLR437C 402 nt9.91□□□□□ -0.82
ROK1P45818 YMR226CYMR226C 804 nt9.91□□□□□ -0.82
ROK1P45818 SSN3YPL042C 1668 nt9.9□□□□□ -0.82
ROK1P45818 FIT3YOR383C 615 nt9.9□□□□□ -0.82
ROK1P45818 TSC10YBR265W 963 nt9.9□□□□□ -0.82
ROK1P45818 SDH5YOL071W 489 nt9.89□□□□□ -0.83
ROK1P45818 SAM35YHR083W 990 nt9.87□□□□□ -0.83
ROK1P45818 RBG2YGR173W 1107 nt9.86□□□□□ -0.83
ROK1P45818 PRM5YIL117C 957 nt9.85□□□□□ -0.83
ROK1P45818 YLR111WYLR111W 333 nt9.85□□□□□ -0.83
ROK1P45818 YAR028WYAR028W 705 nt9.85□□□□□ -0.83
ROK1P45818 RAD23YEL037C 1197 nt9.84□□□□□ -0.83
ROK1P45818 YGR012WYGR012W 1182 nt9.83□□□□□ -0.84
ROK1P45818 FRE6YLL051C 2139 nt9.82□□□□□ -0.84
ROK1P45818 YLR279WYLR279W 390 nt9.8□□□□□ -0.84
ROK1P45818 BIO5YNR056C 1686 nt9.8□□□□□ -0.84
ROK1P45818 ALP1YNL270C 1722 nt9.79□□□□□ -0.84
ROK1P45818 MTG2YHR168W 1557 nt9.78□□□□□ -0.84
ROK1P45818 ALD4YOR374W 1560 nt9.78□□□□□ -0.84
ROK1P45818 AKR2YOR034C 2250 nt9.74□□□□□ -0.85
ROK1P45818 RIB3YDR487C 627 nt9.74□□□□□ -0.85
ROK1P45818 MSB4YOL112W 1479 nt9.73□□□□□ -0.85
ROK1P45818 HIF1YLL022C 1158 nt9.73□□□□□ -0.85
ROK1P45818 ZTA1YBR046C 1005 nt9.73□□□□□ -0.85
ROK1P45818 NAR1YNL240C 1476 nt9.72□□□□□ -0.85
ROK1P45818 SED1YDR077W 1017 nt9.72□□□□□ -0.85
ROK1P45818 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.72□□□□□ -0.85
ROK1P45818 DBP1YPL119C 1854 nt9.7□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.69□□□□□ -0.86
ROK1P45818 CAB5YDR196C 726 nt9.68□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 LIP1YMR298W 453 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.67□□□□□ -0.86
ROK1P45818 HXT1YHR094C 1713 nt9.66□□□□□ -0.86
ROK1P45818 PBP1YGR178C 2169 nt9.63□□□□□ -0.87
ROK1P45818 GID7YCL039W 2238 nt9.62□□□□□ -0.87
ROK1P45818 FCY21YER060W 1587 nt9.6□□□□□ -0.87
ROK1P45818 YBL086CYBL086C 1401 nt9.6□□□□□ -0.87
ROK1P45818 GND1YHR183W 1470 nt9.59□□□□□ -0.87
ROK1P45818 APT2YDR441C 546 nt9.59□□□□□ -0.87
ROK1P45818 SAM1YLR180W 1149 nt9.59□□□□□ -0.87
ROK1P45818 CMP2YML057W 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
ROK1P45818 LEU9YOR108W 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
ROK1P45818 CYT2YKL087C 675 nt9.58□□□□□ -0.88
ROK1P45818 YPL251WYPL251W 303 nt9.56□□□□□ -0.88
ROK1P45818 ZRT3YKL175W 1512 nt9.56□□□□□ -0.88
ROK1P45818 LOT5YKL183W 921 nt9.55□□□□□ -0.88
ROK1P45818 BRR1YPR057W 1026 nt9.55□□□□□ -0.88
ROK1P45818 SHY1YGR112W 1170 nt9.54□□□□□ -0.88
ROK1P45818 UGA4YDL210W 1716 nt9.53□□□□□ -0.88
ROK1P45818 YPI1YFR003C 468 nt9.52□□□□□ -0.89
ROK1P45818 SMM1YNR015W 1155 nt9.52□□□□□ -0.89
ROK1P45818 BSP1YPR171W 1731 nt9.51□□□□□ -0.89
ROK1P45818 TOA2YKL058W 369 nt9.51□□□□□ -0.89
ROK1P45818 MEP3YPR138C 1470 nt9.49□□□□□ -0.89
ROK1P45818 UFO1YML088W 2007 nt9.48□□□□□ -0.89
ROK1P45818 URA6YKL024C 615 nt9.48□□□□□ -0.89
ROK1P45818 MET2YNL277W 1461 nt9.47□□□□□ -0.89
ROK1P45818 YMR103CYMR103C 363 nt9.47□□□□□ -0.89
ROK1P45818 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.46□□□□□ -0.9
ROK1P45818 PRY1YJL079C 900 nt9.46□□□□□ -0.9
ROK1P45818 ADH1YOL086C 1047 nt9.45□□□□□ -0.9
ROK1P45818 GND2YGR256W 1479 nt9.45□□□□□ -0.9
ROK1P45818 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.44□□□□□ -0.9
ROK1P45818 NPP1YCR026C 2229 nt9.43□□□□□ -0.9
ROK1P45818 HEL2YDR266C 1920 nt9.43□□□□□ -0.9
ROK1P45818 YNR029CYNR029C 1290 nt9.42□□□□□ -0.9
ROK1P45818 HXT12YIL170W 1374 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms