Protein–RNA interactions for Protein: P40454

RRD1, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRD1P40454 BIO4YNR057C 714 nt11.55□□□□□ -0.56
RRD1P40454 MET8YBR213W 825 nt11.55□□□□□ -0.56
RRD1P40454 SRN2YLR119W 642 nt11.54□□□□□ -0.56
RRD1P40454 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.52□□□□□ -0.57
RRD1P40454 YCP4YCR004C 744 nt11.51□□□□□ -0.57
RRD1P40454 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.51□□□□□ -0.57
RRD1P40454 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.5□□□□□ -0.57
RRD1P40454 SFA1YDL168W 1161 nt11.5□□□□□ -0.57
RRD1P40454 YFL067WYFL067W 528 nt11.5□□□□□ -0.57
RRD1P40454 UTH1YKR042W 1098 nt11.49□□□□□ -0.57
RRD1P40454 ANP1YEL036C 1503 nt11.47□□□□□ -0.57
RRD1P40454 KRE1YNL322C 942 nt11.47□□□□□ -0.57
RRD1P40454 SSA4YER103W 1929 nt11.46□□□□□ -0.58
RRD1P40454 YIR016WYIR016W 798 nt11.45□□□□□ -0.58
RRD1P40454 ATF2YGR177C 1608 nt11.44□□□□□ -0.58
RRD1P40454 YLR122CYLR122C 378 nt11.43□□□□□ -0.58
RRD1P40454 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.43□□□□□ -0.58
RRD1P40454 MEP2YNL142W 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
RRD1P40454 Q0144Q0144 330 nt11.42□□□□□ -0.58
RRD1P40454 YOR343CYOR343C 327 nt11.42□□□□□ -0.58
RRD1P40454 LOT5YKL183W 921 nt11.4□□□□□ -0.58
RRD1P40454 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.39□□□□□ -0.59
RRD1P40454 GND1YHR183W 1470 nt11.38□□□□□ -0.59
RRD1P40454 ABZ2YMR289W 1125 nt11.37□□□□□ -0.59
RRD1P40454 SEM1YDR363W-A 270 nt11.36□□□□□ -0.59
RRD1P40454 YMR206WYMR206W 942 nt11.36□□□□□ -0.59
RRD1P40454 XDJ1YLR090W 1380 nt11.36□□□□□ -0.59
RRD1P40454 PAR32YDL173W 888 nt11.35□□□□□ -0.59
RRD1P40454 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.35□□□□□ -0.59
RRD1P40454 YPL251WYPL251W 303 nt11.34□□□□□ -0.59
RRD1P40454 GIS3YLR094C 1509 nt11.31□□□□□ -0.6
RRD1P40454 MSB4YOL112W 1479 nt11.3□□□□□ -0.6
RRD1P40454 SIM1YIL123W 1431 nt11.29□□□□□ -0.6
RRD1P40454 SAM50YNL026W 1455 nt11.28□□□□□ -0.6
RRD1P40454 ERF2YLR246W 1080 nt11.27□□□□□ -0.61
RRD1P40454 GDH3YAL062W 1374 nt11.25□□□□□ -0.61
RRD1P40454 DCW1YKL046C 1350 nt11.23□□□□□ -0.61
RRD1P40454 ALD4YOR374W 1560 nt11.23□□□□□ -0.61
RRD1P40454 APT2YDR441C 546 nt11.22□□□□□ -0.61
RRD1P40454 SPG1YGR236C 288 nt11.22□□□□□ -0.61
RRD1P40454 NRT1YOR071C 1797 nt11.21□□□□□ -0.61
RRD1P40454 ARP10YDR106W 855 nt11.21□□□□□ -0.61
RRD1P40454 CRR1YLR213C 1269 nt11.18□□□□□ -0.62
RRD1P40454 HIP1YGR191W 1812 nt11.18□□□□□ -0.62
RRD1P40454 EDC2YER035W 438 nt11.16□□□□□ -0.62
RRD1P40454 RIB2YOL066C 1776 nt11.16□□□□□ -0.62
RRD1P40454 TOM20YGR082W 552 nt11.15□□□□□ -0.62
RRD1P40454 YDL221WYDL221W 552 nt11.14□□□□□ -0.63
RRD1P40454 SNG1YGR197C 1644 nt11.13□□□□□ -0.63
RRD1P40454 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.11□□□□□ -0.63
RRD1P40454 CCT5YJR064W 1689 nt11.11□□□□□ -0.63
RRD1P40454 EMI2YDR516C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
RRD1P40454 HRA1HRA1 564 nt11.09□□□□□ -0.63
RRD1P40454 LCP5YER127W 1074 nt11.08□□□□□ -0.64
RRD1P40454 TAF13YML098W 504 nt11.08□□□□□ -0.64
RRD1P40454 YMR090WYMR090W 684 nt11.08□□□□□ -0.64
RRD1P40454 SWM1YDR260C 513 nt11.07□□□□□ -0.64
RRD1P40454 URH1YDR400W 1023 nt11.06□□□□□ -0.64
RRD1P40454 PEX2YJL210W 816 nt11.06□□□□□ -0.64
RRD1P40454 YPL247CYPL247C 1572 nt11.06□□□□□ -0.64
RRD1P40454 TUB4YLR212C 1422 nt11.05□□□□□ -0.64
RRD1P40454 MET28YIR017C 564 nt11.04□□□□□ -0.64
RRD1P40454 HXT12YIL170W 1374 nt11.03□□□□□ -0.64
RRD1P40454 YCR102CYCR102C 1107 nt11.03□□□□□ -0.64
RRD1P40454 TOM6YOR045W 186 nt11.03□□□□□ -0.64
RRD1P40454 FIT3YOR383C 615 nt11.02□□□□□ -0.65
RRD1P40454 BDF1YLR399C 2061 nt11.02□□□□□ -0.65
RRD1P40454 SMM1YNR015W 1155 nt11.01□□□□□ -0.65
RRD1P40454 HEM12YDR047W 1089 nt10.99□□□□□ -0.65
RRD1P40454 UTP6YDR449C 1323 nt10.99□□□□□ -0.65
RRD1P40454 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.98□□□□□ -0.65
RRD1P40454 YBR220CYBR220C 1683 nt10.96□□□□□ -0.65
RRD1P40454 GSF2YML048W 1212 nt10.96□□□□□ -0.65
RRD1P40454 SDH8YBR269C 417 nt10.96□□□□□ -0.65
RRD1P40454 Q0142Q0142 177 nt10.95□□□□□ -0.66
RRD1P40454 PET20YPL159C 762 nt10.95□□□□□ -0.66
RRD1P40454 SHH4YLR164W 507 nt10.94□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YMR262WYMR262W 942 nt10.94□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YNL195CYNL195C 786 nt10.94□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YCR099CYCR099C 468 nt10.93□□□□□ -0.66
RRD1P40454 TIR3YIL011W 810 nt10.93□□□□□ -0.66
RRD1P40454 MIC10YCL057C-A 294 nt10.93□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YGR201CYGR201C 678 nt10.92□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YMR007WYMR007W 381 nt10.92□□□□□ -0.66
RRD1P40454 THI72YOR192C 1800 nt10.92□□□□□ -0.66
RRD1P40454 SDH1YKL148C 1923 nt10.9□□□□□ -0.66
RRD1P40454 YML089CYML089C 369 nt10.9□□□□□ -0.66
RRD1P40454 RCR1YBR005W 642 nt10.9□□□□□ -0.66
RRD1P40454 TIF6YPR016C 738 nt10.9□□□□□ -0.66
RRD1P40454 MIC12YBR262C 321 nt10.89□□□□□ -0.67
RRD1P40454 SCC4YER147C 1875 nt10.87□□□□□ -0.67
RRD1P40454 TAT1YBR069C 1860 nt10.87□□□□□ -0.67
RRD1P40454 HMT1YBR034C 1047 nt10.87□□□□□ -0.67
RRD1P40454 POM34YLR018C 900 nt10.86□□□□□ -0.67
RRD1P40454 Q0017Q0017 162 nt10.86□□□□□ -0.67
RRD1P40454 SEC11YIR022W 504 nt10.85□□□□□ -0.67
RRD1P40454 PRE5YMR314W 705 nt10.85□□□□□ -0.67
RRD1P40454 YJL118WYJL118W 660 nt10.83□□□□□ -0.68
RRD1P40454 SKG1YKR100C 1068 nt10.83□□□□□ -0.68
RRD1P40454 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.2 ms