Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 69.5
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GTF2F1P35269 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 320.26■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 69.5
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GTF2F1P35269 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-13■■■■■ 66.8
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GTF2F1P35269 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 EEF1AKMT2-203ENST00000466270 3587 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 TMEM63A-202ENST00000436966 454 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 LARP4-212ENST00000548174 584 ntTSL 320.15■□□□□ 0.825e-11■■■■■ 66.1
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GTF2F1P35269 LARP4-214ENST00000548993 790 ntTSL 518.36■□□□□ 0.535e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 66.1
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GTF2F1P35269 LARP4-213ENST00000548697 587 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.145e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-205ENST00000517559 559 ntTSL 412.48□□□□□ -0.415e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-211ENST00000523389 588 ntTSL 311.23□□□□□ -0.615e-11■■■■■ 66.1
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GTF2F1P35269 LARP4-216ENST00000550522 567 ntTSL 46.27□□□□□ -1.415e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 325.92■■□□□ 1.744e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.494e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.34e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 65.9
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