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Protein–RNA interactions for Protein: P25042
ROX1, Repressor ROX1, yeast
Predictions only
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368 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROX1
P25042
YOR325W
YOR325W
474 nt
11.35
□□□□□ -0.59
ROX1
P25042
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
11.32
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
11.32
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
DBP1
YPL119C
1854 nt
11.32
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
POM34
YLR018C
900 nt
11.31
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
ATG15
YCR068W
1563 nt
11.31
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
HXT1
YHR094C
1713 nt
11.31
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
PEX25
YPL112C
1185 nt
11.3
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
SHY1
YGR112W
1170 nt
11.28
□□□□□ -0.6
ROX1
P25042
ILV3
YJR016C
1758 nt
11.27
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
YFL066C
YFL066C
1179 nt
11.27
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
DIF1
YLR437C
402 nt
11.26
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
MAE1
YKL029C
2010 nt
11.25
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
VPS75
YNL246W
795 nt
11.25
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
YMR209C
YMR209C
1374 nt
11.21
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
HUA1
YGR268C
597 nt
11.21
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
YIL100C-A
YIL100C-A
339 nt
11.21
□□□□□ -0.61
ROX1
P25042
RET2
YFR051C
1641 nt
11.2
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
TOM6
YOR045W
186 nt
11.19
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
SFA1
YDL168W
1161 nt
11.18
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YHL019W-A
YHL019W-A
594 nt
11.18
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YBL086C
YBL086C
1401 nt
11.18
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
COQ8
YGL119W
1506 nt
11.17
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YER190C-A
YER190C-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YGR296C-A
YGR296C-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YML133W-A
YML133W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YNL339W-A
YNL339W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YPL283W-A
YPL283W-A
576 nt
11.16
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
UGP1
YKL035W
1500 nt
11.15
□□□□□ -0.62
ROX1
P25042
YML089C
YML089C
369 nt
11.14
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
ARO8
YGL202W
1503 nt
11.14
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
YDR010C
YDR010C
333 nt
11.12
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
CWC15
YDR163W
528 nt
11.12
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
MRP20
YDR405W
792 nt
11.11
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
LIP1
YMR298W
453 nt
11.11
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
BET2
YPR176C
978 nt
11.11
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
HIS2
YFR025C
1008 nt
11.1
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
PAU7
YAR020C
168 nt
11.1
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
CCT2
YIL142W
1584 nt
11.1
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
OPI10
YOL032W
741 nt
11.09
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
ACO2
YJL200C
2370 nt
11.09
□□□□□ -0.63
ROX1
P25042
PEX2
YJL210W
816 nt
11.07
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
SHB17
YKR043C
816 nt
11.07
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
UFO1
YML088W
2007 nt
11.06
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
URA6
YKL024C
615 nt
11.06
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
TIF6
YPR016C
738 nt
11.06
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
KES1
YPL145C
1305 nt
11.06
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
SED1
YDR077W
1017 nt
11.04
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
SGA1
YIL099W
1650 nt
11.04
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
LSB6
YJL100W
1824 nt
11.03
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
ZTA1
YBR046C
1005 nt
11.03
□□□□□ -0.64
ROX1
P25042
YAR028W
YAR028W
705 nt
11.01
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
PRE6
YOL038W
765 nt
11.01
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
SAM1
YLR180W
1149 nt
11
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
TOA2
YKL058W
369 nt
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□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
LEU9
YOR108W
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□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
OYE3
YPL171C
1203 nt
10.98
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
YPL251W
YPL251W
303 nt
10.98
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
MTG2
YHR168W
1557 nt
10.98
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
BRR1
YPR057W
1026 nt
10.97
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
HIP1
YGR191W
1812 nt
10.97
□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
GND2
YGR256W
1479 nt
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□□□□□ -0.65
ROX1
P25042
ZAP1
YJL056C
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□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
PET8
YNL003C
855 nt
10.94
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
YFR018C
YFR018C
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10.93
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
SPP2
YOR148C
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10.93
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
ACH1
YBL015W
1581 nt
10.93
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
MET2
YNL277W
1461 nt
10.93
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
PHO89
YBR296C
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10.92
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
RSC8
YFR037C
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10.92
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
PSD1
YNL169C
1503 nt
10.92
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
FMS1
YMR020W
1527 nt
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□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
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10.91
□□□□□ -0.66
ROX1
P25042
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YIL121W
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10.88
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
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YLR403W
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□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
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YNR041C
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□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
TRT2
tT(CGU)K
72 nt
10.87
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
MET28
YIR017C
564 nt
10.86
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
MIR1
YJR077C
936 nt
10.86
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
YMR103C
YMR103C
363 nt
10.86
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
FLR1
YBR008C
1647 nt
10.86
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
UBA4
YHR111W
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10.84
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
SBA1
YKL117W
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10.84
□□□□□ -0.67
ROX1
P25042
DMA2
YNL116W
1569 nt
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□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
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YMR135C
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□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
MEP3
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ROX1
P25042
ADO1
YJR105W
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10.82
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
YHL008C
YHL008C
1884 nt
10.81
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
YPS3
YLR121C
1527 nt
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□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
MRS6
YOR370C
1812 nt
10.8
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
ODC1
YPL134C
933 nt
10.8
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
ALP1
YNL270C
1722 nt
10.8
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
NRT1
YOR071C
1797 nt
10.8
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
VPS62
YGR141W
1404 nt
10.79
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
CYT1
YOR065W
930 nt
10.78
□□□□□ -0.68
ROX1
P25042
SAM2
YDR502C
1155 nt
10.77
□□□□□ -0.69
ROX1
P25042
MRPL8
YJL063C
717 nt
10.77
□□□□□ -0.69
ROX1
P25042
YSR3
YKR053C
1215 nt
10.76
□□□□□ -0.69
ROX1
P25042
DLD2
YDL178W
1593 nt
10.75
□□□□□ -0.69
ROX1
P25042
DIG1
YPL049C
1359 nt
10.75
□□□□□ -0.69
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