Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR6Q9Y2C9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR6Q9Y2C9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms