Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TOPBP1Q92547 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOPBP1Q92547 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms