Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms