Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RRN3P1Q2M238 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RRN3P1Q2M238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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