Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL24A1Q17RW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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COL24A1Q17RW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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COL24A1Q17RW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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COL24A1Q17RW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
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COL24A1Q17RW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL24A1Q17RW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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