Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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