Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARID3CA6NKF2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms