Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB6Q9Y5E3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB6Q9Y5E3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms