Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCF1Q9Y324 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCF1Q9Y324 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms