Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRP68Q9UHB9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms