Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TREX1Q9NSU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms