Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASS4Q9NQ75 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASS4Q9NQ75 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms