Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPRD1AQ96P16 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms