Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C17orf53Q8N3J3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms