Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNI3KQ59H18 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNI3KQ59H18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms