Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH18Q13634 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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