Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF2Q12772 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
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