Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RRP7YCL031C 894 nt4.09□□□□□ -1.75
NMD4Q12129 YOL153CYOL153C 1746 nt4.09□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RNA14YMR061W 2034 nt4.09□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 ISW2YOR304W 3363 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RXT3YDL076C 885 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MTH1YDR277C 1302 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BCP1YDR361C 852 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PRP3YDR473C 1410 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PLM2YDR501W 1566 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YHI9YHR029C 885 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 TPD3YAL016W 1908 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 ARC19YKL013C 516 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PFK27YOL136C 1194 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 CEX1YOR112W 2286 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YOR263CYOR263C 408 nt4.08□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YCR023CYCR023C 1836 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 DSN1YIR010W 1731 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PLP1YDR183W 693 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 GIC2YDR309C 1152 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BNA6YFR047C 888 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 COX4YGL187C 468 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YIL171WYIL171W 330 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 FIP1YJR093C 984 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 CPR8YNR028W 927 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 ATG5YPL149W 885 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YBR238CYBR238C 2196 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BUD5YCR038C 1929 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 AEP3YPL005W 1821 nt4.07□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MIC60YKR016W 1623 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PRP9YDL030W 1593 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 FOX2YKR009C 2703 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RSM26YJR101W 801 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RPF2YKR081C 1035 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YML053CYML053C 639 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 ERV41YML067C 1059 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YPL025CYPL025C 558 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 CET1YPL228W 1650 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 SEN1YLR430W 6696 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YPK9YOR291W 4419 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 GDH2YDL215C 3279 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 UBP12YJL197W 3765 nt4.06□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 LAS1YKR063C 1509 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 VPS45YGL095C 1734 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 OCA4YCR095C 1089 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BMH1YER177W 804 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RPL24AYGL031C 468 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 FSH1YHR049W 732 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 TOM7YNL070W 183 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MDM12YOL009C 816 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PNO1YOR145C 825 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 AIM21YIR003W 2040 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MNN1YER001W 2289 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MDM10YAL010C 1482 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 SNF2YOR290C 5112 nt4.05□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 HOYDL227C 1761 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 FLO8YER109C 2400 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 GRX3YDR098C 858 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YGL177WYGL177W 348 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 AIM22YJL046W 1230 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 BAT2YJR148W 1131 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YML094C-AYML094C-A 402 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PML39YML107C 1005 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RUF21RUF21 707 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YNL057WYNL057W 333 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 COS1YNL336W 1146 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 TAF3YPL011C 1062 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 SDS23YGL056C 1584 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 UTP25YIL091C 2166 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YOR365CYOR365C 2112 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RSC3YDR303C 2658 nt4.04□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 GEM1YAL048C 1989 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RIA1YNL163C 3333 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 RPG1YBR079C 2895 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 NAT1YDL040C 2565 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 THI13YDL244W 1023 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 KRE28YDR532C 1158 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YGR026WYGR026W 837 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YPT35YHR105W 645 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 EFB1YAL003W 621 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 THI11YJR156C 1023 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 ISA1YLL027W 753 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 PAM18YLR008C 507 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YNL035CYNL035C 1170 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 SYC1YOR179C 567 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 CAF20YOR276W 486 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 MRPL51YPR100W 423 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YBR096WYBR096W 693 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 YBR292CYBR292C 372 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 POF1YCL047C 777 nt4.03□□□□□ -1.76
NMD4Q12129 UBX5YDR330W 1503 nt4.03□□□□□ -1.76
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