Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1Q01196 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms