Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGAEP38570 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms