Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSO75390 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSO75390 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSO75390 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSO75390 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSO75390 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSO75390 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSO75390 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSO75390 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSO75390 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSO75390 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSO75390 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSO75390 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSO75390 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms