Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTH4Q9UIA0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms