Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C19orf12Q9NSK7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C19orf12Q9NSK7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms