Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATXN2Q99700 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN2Q99700 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms