Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC93Q567U6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC93Q567U6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC93Q567U6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms