Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRKQ15262 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTPRKQ15262 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRKQ15262 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
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