Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB1P62873 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB1P62873 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GNB1P62873 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNB1P62873 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GNB1P62873 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms