Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB2P55268 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMB2P55268 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMB2P55268 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms