Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCP4P48539 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCP4P48539 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCP4P48539 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCP4P48539 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCP4P48539 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms