Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA4P22748 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA4P22748 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA4P22748 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CA4P22748 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CA4P22748 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA4P22748 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CA4P22748 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA4P22748 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA4P22748 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA4P22748 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms