Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP3P12645 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP3P12645 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMP3P12645 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BMP3P12645 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMP3P12645 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP3P12645 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP3P12645 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP3P12645 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BMP3P12645 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMP3P12645 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMP3P12645 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMP3P12645 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMP3P12645 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms