Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNCRIPO60506 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms