Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP3O15049 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
N4BP3O15049 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms