Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEFF2Q9UIK5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms