Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLF1Q9BQI6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLF1Q9BQI6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF1Q9BQI6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms